org.simBio.sim.analyzer.graph.results
Class TimeSeriesValues

java.lang.Object
  org.simBio.sim.analyzer.graph.results.TimeSeriesValues

public class TimeSeriesValues
extends java.lang.Object

計算結果バッファ.

Notice

• 値は、テンポラリファイルに保存されます。
• timeBuffer と dataBuffer は、組で生成され、各々の同じインデックスで結合されます。
• 時刻からインデックスを検索する際、全検索をすると時間がかかるために、下記の手法を取っています。
  1. キャッシュに残っているインデックスであれば、キャッシュの内容を返します。(メモリ:O(1))
  2. 一次索引により、時刻を元にどの範囲のインデックスに含まれるのかを大まかに調査します。(ディスク:O(1))
  3. 2.で得た範囲の時刻データについて、2分探索で検索します。(ディスク:O(log n))
  この手法により、最大10回程度のディスクアクセスにより探索可能となっています.

Author:

misaki

Field Summary

protected long	indexCurrent
protected static Log	log
protected int	numSeries
protected double	timeMax
protected double	timeMin

Constructor Summary

TimeSeriesValues(java.lang.String fileFor)
コンストラクタ データファイル名を元に、テンポラリファイル名を決定する。
"データファイル名" + 数字 + ".tmp"

Method Summary

void	addValue(double time, double[] values) 現在時刻の計算結果を追加する.
void	close() インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.
long	getCurrentIndex() 現在のデータ件数を取得する.
long	getIndexByTime(double searchTime) 指定した時刻に対応するインデックスを取得する.
double	getTime(long index) インデックスを指定して時刻を取得する.
double	getTimeMax() 最大時刻を取得する.
double	getTimeMin() 最小時刻を取得する.
double	getValue(long index, int series) インデックスを指定して計算値を取得する.
void	init(double timeTickSample) 計算結果バッファを初期化する.
void	prepareGetRange(long idxMin, long idxMax, int series) 指定した系列、インデックス範囲のデータを、キャッシュに読み込む.
void	setNumSeries(int numSeries) 系列数をセットする.

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Field Detail

log

protected static Log log

indexCurrent

protected long indexCurrent

timeMax

protected double timeMax

timeMin

protected double timeMin

numSeries

protected int numSeries

Constructor Detail

TimeSeriesValues

public TimeSeriesValues(java.lang.String fileFor)

コンストラクタ データファイル名を元に、テンポラリファイル名を決定する。
"データファイル名" + 数字 + ".tmp"

Method Detail

close

public void close()

インスタンスを使用終了し、バッファファイルを開放する.

setNumSeries

public void setNumSeries(int numSeries)

系列数をセットする.

Parameters:

numSeries - 系列数

init

public void init(double timeTickSample)

計算結果バッファを初期化する.

Parameters:

timeTickSample - データをサンプリングする時刻間隔

addValue

public void addValue(double time,
                     double[] values)

現在時刻の計算結果を追加する.

Parameters:

time - 時刻

values - 各系列の値[0..n-1]

getTime

public double getTime(long index)

インデックスを指定して時刻を取得する.

Parameters:

index - インデックス

getValue

public double getValue(long index,
                       int series)

インデックスを指定して計算値を取得する.

Parameters:

series - 系列番号(0..n-1)

index - インデックス

getIndexByTime

public long getIndexByTime(double searchTime)

指定した時刻に対応するインデックスを取得する.

Parameters:

searchTime - 時刻

Returns:

最も近いインデックス

prepareGetRange

public void prepareGetRange(long idxMin,
                            long idxMax,
                            int series)

指定した系列、インデックス範囲のデータを、キャッシュに読み込む.

Parameters:

idxMin - 最小インデックス

idxMax - 最大インデックス

series - 系列番号(未使用)

getCurrentIndex

public long getCurrentIndex()

現在のデータ件数を取得する.

Returns:

データ件数

getTimeMin

public double getTimeMin()

最小時刻を取得する.

Returns:

最小時刻

getTimeMax

public double getTimeMax()

最大時刻を取得する.

Returns:

最大時刻