org.simBio.bio.function
Class Analytic2state

java.lang.Object
  org.simBio.core.Component
      org.simBio.core.Parameter
          org.simBio.core.Composite
              org.simBio.core.Reactor
                  org.simBio.bio.function.Function
                      org.simBio.bio.function.Analytic2state

All Implemented Interfaces:

Node

public class Analytic2state
extends Function

2 state gateの解析解を求めて現在の解に設定する。 「心臓のフィジオーム」p. 101-104参照。 時定数tauや収束値infinityがdtの間一定と見なせ、かつgateの変化がここだけで計算される場合に成り立つ。 ten Tusscher et al, 2004が公開しているソースでも用いられている方法。 dtを大きく取っても発散しないと思われる。 アドレスはhttp://www-binf.bio.uu.nl/khwjtuss/HVM 恐らくReference No 54の Rush and Larsen, IEEE Trans Biomed Eng 25:389-392, 1978 が詳しいと思われる。 xml/km/0005-2.xmlを参考にしてください。

Version:

$Revision: 1.1 $

Author:

Nobuaki Sarai Created on 2004/05/25

Field Summary

Node	alfa
Node	beta
Node	dt
Node	previous

Fields inherited from class org.simBio.core.Parameter

value

Constructor Summary

Analytic2state()

Method Summary

protected void

calculate(double t) write equations here, and calculate dy over dt.

Methods inherited from class org.simBio.core.Composite

accept, getLink, getNode, getNodesIterator, getNodesSize

Methods inherited from class org.simBio.core.Parameter

addValue, getValue, getValueString, prepare, setInitializer, setValue, setValueString, setValueToField

Methods inherited from class org.simBio.core.Component

addDydt, end, getIndent, getIndentedShortName, getName, getName, getParent, getRoot, getShortName, getUnits, isNamed, isPrefixed, logIndented, quit, setLinks

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Methods inherited from interface org.simBio.core.Node

addDydt, addValue, getValue, setValue

Field Detail

alfa

public Node alfa

beta

public Node beta

previous

public Node previous

dt

public Node dt

Constructor Detail

Analytic2state

public Analytic2state()

Method Detail

calculate

protected void calculate(double t)

Description copied from class: Reactor

write equations here, and calculate dy over dt.
計算中に呼び出される。 計算式を記載する。dy/dtをここで計算する。

Specified by:

calculate in class Reactor

Parameters:

t - elapsed time (ms)